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सीटी वैल्यू फ्लोरोसेंट मात्रात्मक पीसीआर का सबसे महत्वपूर्ण परिणाम प्रस्तुतिकरण रूप है।इसका उपयोग जीन अभिव्यक्ति अंतर या जीन प्रतिलिपि संख्या की गणना करने के लिए किया जाता है।तो प्रतिदीप्ति परिमाणीकरण का सीटी मान क्या उचित माना जाता है?सीटी मान की प्रभावी सीमा कैसे सुनिश्चित करें?

सीटी वैल्यू क्या है?
क्यूपीसीआर प्रवर्धन प्रक्रिया के दौरान, जब प्रवर्धित उत्पाद का प्रतिदीप्ति संकेत निर्धारित प्रतिदीप्ति सीमा तक पहुँच जाता है, तो प्रवर्धन चक्रों (साइकिल थ्रेशोल्ड) की संगत संख्या।C का मतलब साइकिल है और T का मतलब थ्रेशोल्ड है।सीधे शब्दों में कहें तो, सीटी मान उन चक्रों की संख्या है जो प्रारंभिक टेम्पलेट प्रवर्धन qपीसीआर में उत्पाद की एक निश्चित मात्रा तक पहुंचने के अनुरूप होता है।तथाकथित "उत्पाद की एक निश्चित मात्रा" को बाद में और समझाया जाएगा।

Ct मान क्या करता है?

1.घातांकीय प्रवर्धन, टेम्पलेट राशि और सीटी मान के बीच संबंध
आदर्श रूप से, क्यूपीसीआर में जीन एक निश्चित संख्या में चक्रों के बाद घातीय प्रवर्धन द्वारा जमा होते हैं।प्रवर्धन चक्रों की संख्या और उत्पादों की मात्रा के बीच संबंध है: प्रवर्धित उत्पाद राशि = प्रारंभिक टेम्पलेट राशि × (1+एन) चक्र संख्या।हालाँकि, क्यूपीसीआर प्रतिक्रिया हमेशा आदर्श स्थिति में नहीं होती है।जब प्रवर्धित उत्पाद की मात्रा "निश्चित उत्पाद मात्रा" तक पहुंच जाती है, तो इस समय चक्रों की संख्या सीटी मान होती है, और यह घातीय प्रवर्धन अवधि में होती है।सीटी मान और प्रारंभिक टेम्पलेट की मात्रा के बीच संबंध: टेम्पलेट के सीटी मान और टेम्पलेट की प्रारंभिक प्रतिलिपि संख्या के लघुगणक के बीच एक रैखिक संबंध है।प्रारंभिक टेम्प्लेट सांद्रता जितनी अधिक होगी, सीटी मान उतना ही छोटा होगा;प्रारंभिक टेम्प्लेट सांद्रता जितनी कम होगी, Ct मान उतना ही बड़ा होगा।

2. प्रवर्धन वक्र, प्रतिदीप्ति सीमा और निश्चित पीसीआर उत्पाद मात्रा
क्यूपीसीआर प्रवर्धन उत्पाद की मात्रा सीधे फ्लोरोसेंट सिग्नल, यानी प्रवर्धन वक्र के रूप में प्रस्तुत की जाती है।पीसीआर के प्रारंभिक चरण में, प्रवर्धन आदर्श परिस्थितियों में होता है, चक्रों की संख्या छोटी होती है, उत्पाद संचय छोटा होता है, और प्रतिदीप्ति के स्तर को प्रतिदीप्ति पृष्ठभूमि से स्पष्ट रूप से अलग नहीं किया जा सकता है।उसके बाद, प्रतिदीप्ति बढ़ती है और घातीय चरण में प्रवेश करती है।पीसीआर उत्पाद की मात्रा का पता एक निश्चित बिंदु पर लगाया जा सकता है जब पीसीआर प्रतिक्रिया सिर्फ घातीय चरण में होती है, जिसका उपयोग "उत्पाद की एक निश्चित मात्रा" के रूप में किया जा सकता है, और टेम्पलेट की प्रारंभिक सामग्री इससे निकाली जा सकती है।इसलिए, उत्पाद की एक निश्चित मात्रा के अनुरूप प्रतिदीप्ति संकेत तीव्रता प्रतिदीप्ति सीमा है।

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पीसीआर के अंतिम चरण में, प्रवर्धन वक्र अब घातीय प्रवर्धन नहीं दिखाता है, और रैखिक चरण और पठार चरण में प्रवेश करता है।

3. सीटी मानों की पुनरुत्पादकता
जब पीसीआर चक्र सीटी मान की चक्र संख्या तक पहुंचता है, तो यह वास्तविक घातीय प्रवर्धन अवधि में प्रवेश कर चुका होता है।इस समय, छोटी त्रुटि को प्रवर्धित नहीं किया गया है, इसलिए सीटी मान की प्रतिलिपि प्रस्तुत करने योग्यता उत्कृष्ट है, अर्थात, एक ही टेम्पलेट को अलग-अलग समय पर या एक ही समय में अलग-अलग ट्यूबों में प्रवर्धित किया जाता है।प्रवर्धन, प्राप्त Ct मान स्थिर है।

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1.प्रवर्धन दक्षता एन
पीसीआर प्रवर्धन दक्षता उस दक्षता को संदर्भित करती है जिसके साथ पोलीमरेज़ जीन को प्रवर्धित करने के लिए एम्प्लिकॉन में परिवर्तित करता है।जब एक डीएनए अणु दो डीएनए अणुओं में परिवर्तित होता है तो प्रवर्धन दक्षता 100% होती है।प्रवर्धन दक्षता को आमतौर पर En के रूप में व्यक्त किया जाता है।बाद के लेखों के विश्लेषण को सुविधाजनक बनाने के लिए, प्रवर्धन दक्षता को प्रभावित करने वाले कारकों को संक्षेप में प्रस्तुत किया गया है।

प्रभावित करने वाले साधन व्याख्या न्याय कैसे करें?
ए. पीसीआर अवरोधक 1. टेम्पलेट डीएनए में ऐसे पदार्थ होते हैं जो पीसीआर प्रतिक्रिया को रोकते हैं, जैसे प्रोटीन या डिटर्जेंट।2. रिवर्स ट्रांसक्रिप्शन के बाद सीडीएनए में टेम्पलेट आरएनए या आरटी अभिकर्मक घटकों की उच्च सांद्रता होती है, जो बाद की पीसीआर प्रतिक्रिया को भी रोक सकती है। 1. प्रदूषण है या नहीं इसका अंदाजा A260/A280 और A260/A230 या RNA वैद्युतकणसंचलन के अनुपात को मापकर लगाया जा सकता है।2. क्या रिवर्स ट्रांसक्रिप्शन के बाद सीडीएनए को एक निश्चित अनुपात के अनुसार पतला किया जाता है।
बी. अनुचित प्राइमर डिज़ाइन प्राइमर कुशलतापूर्वक ठीक नहीं होते हैं प्राइमर-डिमर्स या हेयरपिन, बेमेल और कभी-कभी फैले हुए पुराने डिज़ाइन के लिए प्राइमर की जाँच करें।
सी. अनुचित पीसीआर प्रतिक्रिया कार्यक्रम डिजाइन 1. प्राइमर प्रभावी ढंग से एनील नहीं कर सकते2. डीएनए पोलीमरेज़ का अपर्याप्त रिलीज

3. लंबे समय तक उच्च तापमान वाले डीएनए पोलीमरेज़ गतिविधि में कमी आई

1. एनीलिंग तापमान प्राइमर के टीएम मान से अधिक है2. पूर्व-विकृतीकरण का समय बहुत कम है

3. प्रतिक्रिया प्रक्रिया के प्रत्येक चरण का समय बहुत लंबा है

डी. अभिकर्मकों का अपर्याप्त मिश्रण या पिपेटिंग त्रुटियाँ प्रतिक्रिया प्रणाली में, पीसीआर प्रतिक्रिया घटकों की स्थानीय सांद्रता बहुत अधिक या असमान है, जिसके परिणामस्वरूप पीसीआर प्रवर्धन का गैर-घातीय प्रवर्धन होता है  
ई. एम्प्लिकॉन लंबाई एम्प्लिकॉन की लंबाई बहुत लंबी है, 300बीपी से अधिक है, और प्रवर्धन दक्षता कम है जांचें कि एम्प्लिकॉन की लंबाई 80-300bp के बीच है
एफ. क्यूपीसीआर अभिकर्मकों का प्रभाव अभिकर्मक में डीएनए पोलीमरेज़ की सांद्रता कम है या बफर में आयनों की सांद्रता अनुकूलित नहीं है, जिसके परिणामस्वरूप टैक एंजाइम गतिविधि अधिकतम तक नहीं पहुंच पाती है मानक वक्र द्वारा प्रवर्धन दक्षता का निर्धारण

2.सीटी मानों की रेंज
सीटी मान 15-35 के बीच होता है।यदि सीटी मान 15 से कम है, तो यह माना जाता है कि प्रवर्धन आधारभूत अवधि की सीमा के भीतर है और प्रतिदीप्ति सीमा तक नहीं पहुंचा गया है।आदर्श रूप से, सीटी मान और टेम्पलेट की प्रारंभिक प्रतिलिपि संख्या के लघुगणक, यानी मानक वक्र के बीच एक रैखिक संबंध होता है।मानक वक्र के माध्यम से, जब प्रवर्धन दक्षता 100% होती है, तो जीन की एकल प्रतिलिपि संख्या को मापने के लिए गणना की गई सीटी मान 35 के आसपास होती है। यदि यह 35 से अधिक है, तो टेम्पलेट की प्रारंभिक प्रतिलिपि संख्या सैद्धांतिक रूप से 1 से कम है, जिसे अर्थहीन माना जा सकता है।

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विभिन्न जीन सीटी श्रेणियों के लिए, प्रारंभिक टेम्पलेट राशि में जीन प्रतिलिपि संख्या और प्रवर्धन दक्षता में अंतर के कारण, जीन के लिए एक मानक वक्र बनाना और जीन की रैखिक पहचान सीमा की गणना करना आवश्यक है।

3.सीटी मान को प्रभावित करने वाले कारक
प्रवर्धन चक्रों की संख्या और उत्पाद की मात्रा के बीच संबंध से: प्रवर्धित उत्पाद की मात्रा = प्रारंभिक टेम्पलेट की मात्रा × (1+एन) चक्र संख्या, यह देखा जा सकता है कि आदर्श परिस्थितियों में, प्रारंभिक टेम्पलेट और एन की मात्रा सीटी मान पर नकारात्मक प्रभाव डालेगी।टेम्प्लेट गुणवत्ता या प्रवर्धन दक्षता में अंतर के कारण सीटी मान बहुत बड़ा या बहुत छोटा हो जाएगा।

4.सीटी मान बहुत बड़ा या बहुत छोटा है

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पोस्ट करने का समय: फरवरी-22-2023